Utilização de alinhamento estrutural de proteínas no estudo de Interface Forming Residues de proteína-quinases com inibidores protéicos.

Alinhamento estrutural de proteínas e análise de interação proteína-inibidor. As proteínas-quinases (PK) como alvo biológico. Três grupos de estruturas diferentes no domínio catalítico de PK. Superposição dos dados obtidos no alinhamento sequencial e estrutural.bitstream/CNPTIA/9905/1/comuntec44.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Determinação da estrutura e estudo da função da metalotioneína de Synechococcus com ferramentas da bioinformática.

Este trabalho abordou a análise estrutural das MTs a fim de se modelar esta proteína e com isso compreender melhor o funcionamento da mesma. O conhecimento da cianobactéria e uma completa análise da MT poderia ser muito útil em um estudo de utilização desta na técnica da biorremediação para remover metais pesados do solo e da água decorrentes das praticas agrícolas atuais.bitstream/CNPTIA/9902/1/comuntec43.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Estudo da influência de seqüências polipeptídicas e de códons na determinação da estrutura secundária de proteínas.

O propósito desse trabalho foi descrever e quantificar os casos de polipeptídicos idênticos em diferentes estruturas secundárias, encontrados em banco de dados de estrutura: Protein Data Bank (PDB).bitstream/CNPTIA/9901/1/comuntec42.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Protein dossier and protein fingerprints produce surface signatures: a simple and powerful technique for coding and comparing compound and receptor shape information.

The objective of this work is to analyze the structural interaction between serine proteases and theirs inhibitors using amino acids residues present in the interface of this molecules to discovery complex patterns of recognition and specificity.X-meeting 2007

DIPN: a dictionary of the internal proteins nanoenvironments and their potential for transformation into agricultural assets.

Introduction. Protein nanoenvironments and their characteristics: List of physicochemical and structural descriptors that characterize specific nanoenvironments. Contributions: what does knowledge about protein nanoenvironments entail? A dictionary of nanoenvironment descriptors will impact the variety of research aimed at innovation in areas such as agriculture, medicine, and biology in general. Final considerations

VPRO - um identificador de padrões de seqüências.

bitstream/CNPTIA/11542/1/ct81.pdfAcesso em: 28 maio 2008

Utilização da biologia computacional para desenvolvimento de inibidores para a serino proteases do veneno da Crotalus durissus cumanensis.

Na América Latina, picadas de cobras apresentam um grande problema na área de saúde publica. Estima-se que por ano ocorra 130.000-150.000 casos com 2.300 mortes em toda a região. Venenos de cobra são complexas misturas de toxinas e enzimas que mostram diferentes atividades no sistema biológico (tanto às suas presas quanto ao ser humano que acidentalmente for picado)

Curvatura da superfície de proteínas no Java Protein Dossier.

Definição de superfície. Cálculo dos valores de curvatura com SurfRace.bitstream/CNPTIA/9897/1/comuntec38.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Incorporação das propriedades rotâmeros e ocupância em métodos de análise estrutural de proteínas.

Conformação das cadeias laterais (rotâmeros); Dupla ocupância; Java Protein Dossier.bitstream/CNPTIA/9893/1/comuntec34.pdfAcesso em: 30 maio 2008